伊拉克利翁(Heraklion)（希腊语：Ηράκλειο）是希腊位于克里特岛上的最大的城市，同时也是克里特大区和伊拉克利翁州的首府，人口137,711（2001年）。
伊拉克利翁是弥诺斯文明时期克里特岛最大的人口中心，雅典第五大城市，也是克里特岛的首府。据说古希腊神话中米诺斯王的王宫，米诺斯迷宫就建在这里。由阿瑟·埃文斯发现并发掘的克诺索斯宫殿遗址就位于附近。由此可以推断大约在公元前2000年左右这里应该有港口存在，但这一推断并未得到考古证据证明。
埃及伊拉克利翁古城拥有着美丽而神秘的传说，它曾是一个繁「荣的海港城市，在1500年前沉入海底，希腊历史学家希罗多德曾在公元前5世纪赞美伊拉克利翁是一座宏伟壮观的城市。
希罗多德还讲述了关于绝世美女海伦的故事，她是当时世界上最美丽的女人，曾在特洛伊战争爆发之前与爱人帕里斯旅行至伊拉克利翁。
但是直到2001年仍未发现任何考古证据证实伊拉克利翁沉没的地点，最终法国海洋考古学家弗兰克-戈迪奥(Franck Goddio)偶然发现一些遗迹，从而证实这是21世纪最伟大的一项考古发现。
后期戈迪奥与牛津海洋考古学研究中心和埃及文物部发现大量的文物，最初阶段考古学家们面临一个棘手任务——如何将海底大量石块碎片重新组装起来。
他们陆续发现一些巨大雕像，其中包括：埃及女神伊希斯、哈皮神、以及一具未辨识的埃及法老雕像，它们保存状况非常完好，是由泥浆完全包裹起来。
伊拉克利翁古城的重要性被进一步证实——发现64艘船，这是在一个地点发现最多数量的古代船只，同时，还发现700多个锚。其它的一些发现展现了伊拉克利翁古城对于古代经济的重要性，发现大量的金币、铅、铜和来自雅典的石头砝码，证实伊拉克利翁曾是地中海最重要的贸易港口。
现代的伊拉克利翁于824年由撒拉逊人建立，命名为andaq.他们在城市周边挖了护城河并允许海盗将其作为避风港。
961年，拜占庭帝国攻占伊拉克利翁，大肆屠杀撒拉逊人，将城市付之一炬并在其重建後对其进行了长达243年的控制。
1203年，第四次东征十字军扶持已被废黜的拜占庭皇帝伊萨克二世重登皇位。作为此次政治交易的一部分，次年，协助过十字军的威尼斯共和国控制了伊拉克利翁。威尼斯人改进加固了城市防御工事并将其更名为意大利语「甘地亚（Candia）」，至今仍有人用此来称呼克里特岛。
1647年，奥斯曼帝国对伊拉克利翁进行了长达22年的围攻，血腥的战争使30,000克里特岛人和120,000土耳其人死亡。威尼斯人最终於1669年投降，奥斯曼帝国占领城市并其及整个克里特岛更名为「Kania」。後来，伊拉克利翁港逐渐淤塞，奥斯曼人将大部分生意都转到了岛西部的哈尼亚。
1898年，奥斯曼人撤离，伊拉克利翁获得独立。1913年，城市成为希腊王国的成员并更名为现名，意为赫拉克勒斯之城（City of Heracles）。